불명열 인수공통전염병 검체의 16S 유전자 라이브러리 분석

초록

목적 : 진료 소견상 발열증상과 세균성 인수공통전염병 및 리케치아 감염으로 의심되는 검체를 대상으로 불명열 질환의 원인 미생물을 비롯한 미지의 병원체들을 밝혀내고, 병원균과의 병리학적 관계를 규정하여 효율적인 병원체 진단 자료를 구축하는데 목적이 있다. 방법 : 불명열 의뢰 검체 중 음성 검체 96건에서 DNA을 추출한 후 universal primer들을 이용하여 미지의 미생물 16S rRNA 유전자를 PCR법으로 증폭하여 cloning vector로 library를 제작하였다. 여기에서 얻어진 클론 library들의 염기서열을 읽어, 지금까지 보고된 16S rRNA 유전자들과 유전자 데이터베이스 상에서 비교하고, 계통 분석을 통하여 검체 내에 존재하는 미생물들을 분석하였다 결과 : 본 실험에서는 불명열 및 인수공통전염병 검체에서 추가적인 인수공통전염병 관련 미생물을 검색하고자 하였으나, 불명열 환자의 혈액으로부터 해양, 토양, 식물 등의 다양한 환경 미생물의 16S rRNA 유전자가 검출되었으며, 병원성 미생물의 유전자로는 Achromobacter xylosoxidans, Bordetella sp., Bacillus cereus, Orientia tsutsugamushi 등의 16S rRNA 유전자가 확인되었다. 결론 : 본 실험에서 사용한 16S rRNA 유전자 분석법은 원인 불명 질환의 감염원을 단계적으로 찾아가는 기존의 진단 방법이나 균 분리 동정 등의 장시간이 걸리고 소모적인 진단법에 비하여 비교적 간단하고 신속하게 원인 병원체를 규명할 수 있는 유용한 진단법으로 이용 가능하다. Achromobacter xylosoxidans가 원인인 낭포성 심낭염의 원인 병원체의 유전자가 확인됨으로써 국내에서도 이 질환의 발생 가능함을 확인하여 추 후 심낭염 발생시 원인 병원체의 추정이 가능하며 효율적인 진단이 가능하리라 예상된다. 또한, 이 연구 결과에서 확인된 환경 및 토양 미생물 등은 추후 발열성 진단을 유전자로 진단 시 발생하는 의양성 반응에서 참고 자료로 할용 할 수 있으리라 예상된다.

키워드