복합형질 질환과 연관된 인간 유전체 Haplotype(일배체형)분석과 한국인 유전체형의 확립과 관련 통합정보의 전달

초록

목적 : 본 연구 과제는 한국인 특유 유전체형을 대규모로 분석하여 새로운 SNP와 haplotype을 비롯한 한국인 특유의 유전체 구조에 대한 정보를 축적하고, 한국인에 중요한 특정 질환과의 연관성을 밝힘으로써 특정 질환의 진단, 치료 및 예방에 필요한 신규 기술의 개발을 촉진할 수 있는 기반을 마련하는 것이다. 특히 인간 유전체형의 haplotype 연구는 한국인에게 빈발하는 당뇨, 천식, 골다공증과 같은 복합질병(complex diseases)의 원인 유전자 탐색에 유용한 지표로 사용될 것으로 기대된다. 방법 : 주요 질병에 관련된 질병 후보 유전자에 대한 SNP(Single Nucleotide Polymorphism, 단일염기서열 다형성) 발굴을 위해 한국인에 빈발하는 주요 질환 중에서 우선적으로 천식 39개, 고혈압 30개, 골다공증 26개 후보 유전자를 선정하여 24명의 DNA 시료를 사용하여 한국인에 존재하는 SNP 발굴 작업을 진행하였다. 결과 : 다수의 새로운 SNP가 질병 후보 유전자에서 sequencing방법으로 발굴되었다. 주요 질병별 후보 유전자에 대한 SNP 발굴 상황은 다음과 같다. 천식 후보 유전자 39개에 대한 SNP 발굴은 완료되어 총 418개의 SNP, 22개의 Insertion/Deletion, 3개의 microsatellites가 발굴되었다. 골다공증 후보 유전자의 SNP 발굴은 선별된 총 26개의 후보 유전자중 18개의 유전자에서 총 140개 의 SNP를 발굴하였으며 고혈압 후보 유전자는 총 30개의 후보 유전자에서 지금까지 300개의 SNP를 발굴하였다. 발굴된 SNP를 사용한 각 유전자의 유전적 변이형의 분포와 haplotype의 종류 및 빈도에 대한 분석을 진행하고 있으며 이들 분석 결과는 각 유전자와 질병간의 연관성 연구에 귀중한 자료로 이용될 것으로 기대 되고 있다. 한편 SNP 유전형 분석에 따르면 한국인은 서양인과 아프리카인과는 아주 상이한 SNP 빈도의 분포를 보였으나 일본인과는 아주 유사한 빈도의 분포를 관측할 수 있었다. 현재 본 연구 과제에서는 질병 후보 유전자에 대한 SNP 발굴, LD block 구조, haplotype형에 대한 분석과 질병 연관성 연구를 진행하고 있다. 결론 : 복합형질 질환의 원인 유전자 규명을 위한 한국인 haplotype 분석 연구는 생물학 및 의학 연구를 위한 기초 기반을 구축하고 소중한 기술적 자원을 제공할 것이다. 따라서 본 연구 과제는 한국인의 복합질병을 위한 질병의 예방, 진단 및 치료법 개발을 촉진할 것으로 기대된다.

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