국내에서 분리된 G형 간염바이러스 NS-5 Region 염기서열의 계통학적 분석

초록

목적 : 국내에서 수집한 227명의 건강인 또는 간염 의심 환자의 혈청으로부터 G형 간염바이러스 감염실태를 파악하고 양성 반응으로 판정된 국내 분리주와 국외에서 발표된 분리주의 NS-5 부위의 일부분에 대한 계통분류학적 분석을 실시하여 그들의 관계를 결정하였다. 방법 : 대상 환자 또는 건강인 혈청으로부터 RNA를 추출하고 random primer와 NS-5 부위를 증폭시킬 수 있는 primer를 사용하여 RT-PCR을 수행하여 cDNA를 합성하고 증폭하였다. 증폭된 5개의 fragment에 대해 TA cloning(Invitrogen)과 sequencing을 실시하고 MegAlign programme(DNAstar Inc)을 이용하여 그들의 sequence를 외국 분리주와 비교분석하였다. 결과 : NS5 부위에 특이한 primer를 사용한 PCR 또는 nested PCR에 의해 HGV를 검색한 결과 간염 증세를 보이는 환자 중 5명의 혈청이 HGV 양성임을 확인하였다. 한편 5‘-NCR 부위를 증폭시킬 수 있는 primer를 사용한 PCR 또는 nested PCR 로는 HGV가 확인되지 않았다. MegAlign programme (DNAstar Inc.)를 사용한 phylogenetic analysis를 수행한 결과 Korean isolate들이 phylogenetic tree에서 다른 국외 분리주보다 clustering 되는 양상을 보여주었다. 결론 : 총 227명의 대상 중 간염 증세를 보이는 환자 중 5명에서만 HGV가 감염되어 있었고 그 5개의 분리주 들간의 관계가 다른 외국 분리주보다 휠씬 가깝다는 것을 확인하였다. 한편 HGV 검색을 위해 사용한 NS5 부위의 동질성이 5´-NCR 부위보다 상대적으로 높다는 것을 알 수 있었다.

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