질병발생예측을 위한 유전형질 질병지표 개발

초록

목적 : 발생빈도가 높은 3개의 생활습관 질병인 당뇨, 천식, 골다공증의 유전적인 요인을 대규모로 발굴하여 각 질병발생을 예측할 수 있는 지표로 활용하고자 함. SNP chip과 같은 초고속 기법을 이용하여 환자와 정상인에서 유전형질의 빈도를 비교 분석하여 질병과 관련된 유전형질을 발굴함. 또한 통계적으로 유의성이 검증된 질병관련 유전형질의 기능연구를 통하여 그 관련성을 검증하고 분자생물학적 단계에서 발병기전을 규명하고자함. 방법 : 질병과 관련된 유전형질을 발굴하기 위하여 안산과 안성 지역사회코호트 또는 질환군별유전체연구센터에서 수집된 환자와 정상인 시료를 이용하여 전장에 걸쳐 50만개의 SNP 정보가 심어진 Affymetrix 500K SNP chip을 이용하여 genotyping을 실시하였음. 질환관련성 통계분석은 1차적으로 GeneSpring GT (Varia co.) 프로그램을 이용하여 질환관련성 유무를 chi-square test를 수행하였음. 그 결과 유의성이 확보된 SNP은 추가로 질병과 관련된 임상정보를 각 genotype별로 ANOVA를 이용하여 분석하였음. 결과 : 당뇨환자 174명와 정상인 128명에 대한 chi-square 분석 결과 p value ＜10⁻⁴ 이하 56개, ＜10⁻³ 이하 298개, <10⁻² 이하 2383개의 SNP를 확보하였음. 골다공증 환자 60명과 정상인 40명에 대한 chi-square 분석 결과 p value <10⁻⁴ 이하 63개, <10⁻³ 이하 259개, <10⁻² 이하 2104개의 유의성 있는 SNP을 확보하였음. 천식환자 100명과 정상인 100명에 대한 chi-square 분석 결과 p value <10⁻⁴ 이하 5개, <10⁻³ 이하 68개, <10⁻² 이하 864개를 확보하였음. 결론 : 본 과제를 통하여 얻어진 통계적으로 유의한 질병관련 유전형질은 2차 case-control 분석을 통하여 검증될 예정이며 확증된 유전형질은 질병발생을 예측하기 위한 바이오마커로 활용될 계획임.

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