국내 감염성 질환 병원체의 성상 분석을 통한 표준 실험실 체계 구축(Ⅲ) : 우리나라 AIDS reagent 프로그램 개발 및 국내 HIV/AIDS 물질 자원화

초록

목적 : HIV-1 은 전세계적으로 지역 또는 역학집단에 따라 유전학적으로 다양한 subtype과 이들에 대한 CRF(circulating recombinant form)이 유행하고 있으며 HIV의 유전적 다양성이 백신개발과 치료효과에 미치는 영향에 대한 연구가 진행되고 있다. 현재까지 HTV env와 nef 유전자 분석을 통한 HTV 유행주 연구에서 우리나라 유행주가 외국 subtype B와는 다른 유전적 특징을 나타냈으므로 우리나라에서 유행하는 HIV-1 subtype B의 full length molecular done을 제작하여 유전적 특성을 연구하고 국내 HTV-1 의 reference reagent를 마련하고자 하였다. 방법 : HIV-1 env(C3V5) 유전자의 염기서열에 근거하여 전형적인 Korean B duster에 속하는 HIV 감염자 7명을 대상군으로 선정하였다. HIV-1 full length의 유전자 특성을 밝히기 위해 대상자의 배양된 PBMCs 로부터 DNA를 분리한 후, 효소중합시험법을 통해 산물을 얻고 이를 cloning하였다. 전형적인 질병진전을 갖는 한 명의 HIV 감염자 clone에 대해 전체염기서열을 분석하였으며 Lasergene과 RIP 프로그램을 통해 다른 분리주와의 염기서열을 비교, 분석하였다. 결과 : 국내에서 유행하는 HIV-1 으로부터 HIV near full length clone 10개, 5’ LTR 부위의 clone 56개, 그리고 3’ LTR 부위의 clone 17개를 확보하고 유전자 특성을 분석하였다. 분석한 HIV-1의 전체 유전자는 mosaic genome를 갖지 않는 전형적인 HIV-1 subtype B로 나타났다. LTR 부위에서 NF-kB 및 Sp family의 유전자는 비교적 잘 보존되어 있었으나 TAR 부위의 +23 위치가 Cytocine으로 나타났고 TATA box가 TAAAA로 변화되는 subtype 표의 특징적인 염기배열이 확인되었으며 TCF-1α 부위에서 duplication이 관찰 되었다. 또한 gag, pol, nef, vif, vpr, upu 유전자 부위에서 일부 염기의 삽입이나 결손이 관찰되었다. 결론 : 국내에서 유행하고 있는 특이적인 HIV-1 subtype B의 near full length clone을 제작하여 국내 HIV 백신과 치료제 개발에 유용한 reagent를 확보하였다. 본 연구에서 분석한 우리 나라 유행주는 외국의 subtype B와는 조사한 모든 유전자 부위에서 구별됨으로써 앞으로 우리나라의 subtype B 유행주의 생물학적 성상과 subtype 표의 특징적인 부위에서 유사한 원인에 대하여 더 많은 연구가 필요하다.

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