HIV-1 감염에 의한 H9 세포주의 유전자발현 변화양상 대량검색

초록

목적 : Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)은 인간의 면역체계에 심각한 결함을 일으키며 숙주세포의 유전자발현에 많은 영향을 미친다. HIV 감염자의 질병 진전도와 감염된 바이러스의 성상에 따라 숙주세포의 mRNA 발현 정도가 달라질 것으로 예측된다. 따라서 in vivo 검체의 여러 제한점을 극복하고 유용한 정보를 얻기 위해서 cDNA microarray를 이용하여 H9 세포에 HIV-1을 감염시켜 숙주 유전자의 발현 양상의 변화를 조사하였다. 방법 : 총 7,4041R의 유전자가 집적된 cDNA chip을 사용하여 human T cell line인 H9 세포에 HIV-1 IIIB를 감염시켜 배양 후 1, 6, 12, 24, 48, 72 및 96 시간에서 숙주 유전자 변화 양상을 분석하였다. 결과 : 전체 7번의 시간대에서 7,404개의 유전자 중 9591R인 13%가 2배 이상 발현되었으며 이중 40.4%인 3871B는 up-regulation되었고, 나머지 59.6%인 5721B는 down regulation되었다. 시간 경과별로 살펴보았을 때 72시간에서 3171B의 유전자가 2배 이상 up regulation되었으며 나머지 시간에서는 2개에서 1391B의 유전자가 2배 이상 up-regulation되었다. 이와는 반대로 6시간을 제외한 모든 시간대에서는 126개에서 349개의 유전자가 2배 이상 down regulation되었다. 특히, 7번의 시간대에서 4번 이상의 시간대에서 2배 이상 up regulation된 유전자는 23개였는데 이들은 대부분 ribosomal 단백질과 MHC 관련 유전자였다 특히, HLA-DRA를 포함한 MHC 관련 유전자는 24시간대부터 꾸준히 up-regulation되었다. 모든 시간대에서 2배 이상 down regulation된 유전자는 30개였는데 이들의 대부분은 합성과 대사에 관련된 유전자들이었다. 결론 : 이번 연구 결과를 통하여 HIV 감염으로 인한 시간 경과에 따라 숙주 내에서 일어나는 유전자의 발현 양상의 변화를 관찰 할 수 있었으며, 향후 HIV 감염과 숙주세포와의 상호작용에 관한 연구에 기초 자료를 제공할 수 있을 것이다.

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