대기오염 기인 노화기전 규명을 위한 후성유전체 연구 인프라 구축

초록

○ 연구개발 목표 - 장기추적 코호트 참여자 대상 후성유전체(DNA methylation) 정보생산을 통한 환경위해요인 연구 기반 구축 ○ 연구개발 내용 - 국립중앙인체자원은행에 보관 중인 대상자 DNA 출고 및 검수 - 검사기관으로 시료의 안정적 운송 및 관리 - 코호트 참여자 후성유전체(DNA methylation) 정보생산 · 대상 : 한국인유전체역학조사(KoGES) 자료 2,106건 · 분석내용 : Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip(935K) · 정도관리 : gDNA, bisulfite converted DNA, 데이터 QC 진행 - 생산 데이터 기초 분석 및 검증 - 다양한 플랫폼을 이용한 DNA methylation 정보 연계분석 방안 제안 ※ 450K, EPIC array(850K, 935K) - 미세먼지 기인 노화 연구를 위한 기반마련 · DNA methylation 활용한 노화지표 구축제안 - 생산 데이터(원시데이터(idat file), Beta value 등) 제출 및 결과보고 ※ 정도관리 및 분석정보 포함 ○ 연구개발 성과 - Methylation EPIC array 생산 정보 (원시 및 가공정보) 및 정도관리 상세 자료 - 결과보고서 ○ 활용계획 및 기대 효과 - 대기오염 기인 노화기전 연구를 위한 후성유전체 정보 확보 - 생산된 정보를 내부 연구과제와 연계하여, 환경요인에 의한 노화 영향 분석 기반 자료로 활용 - 대기오염 기인 노화기전 연구 인프라 구축·공개를 통한 관련 분야 연구 활성화

○ Research Purpose - Establishment of a study foundation for environmental risk factors by production of epigenomic data (DNA methylation) from long-term follow-up cohort participants ○ Research Contents - Release and testing of subject DNA stored at the National Biobank of Korea - Reliably transport and manage samples to the laboratory - Produce cohort participant epigenomic (DNA methylation) data · Subjects: 2,106 data from the Korean Genome Epidemiology Study (KoGES) · Data : Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip(935K) · Quality Control : gDNA, bisulfite converted DNA, data QC - Basic Analysis of epigenome raw data - Proposal for integrated analysis of DNA methylation data using various platforms ※ 450K, EPIC array(850K, 935K) - Laying the groundwork for research on particulate matter-induced aging · Proposal to aging metrics using DNA methylation data - Submit production data (raw data (idat file), beta values, etc.) and report interim/final result report ○ Development Results - Production of epigenome data from 2,106 participants using the Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip(935K) - Quality control and Basic Analysis of Genome Raw Data ○ Expected Contribution - Securing epigenome information for research on air pollution-induced aging mechanisms - Utilizing the information produced as a basis for analyzing the effects of aging caused by environmental factors in connection with internal research projects - Establishing and disclosing research infrastructure for air pollution-induced aging mechanisms to revitalize research in related fields