복합형질 질환과 연관된 인간 유전체 Haplotype(일배체형)과 한국인 유전체형의 확립과 관련 통합정보의 전달

초록

목적 : 본 과제는 한국인의 유전적 변이형을 발굴하고 한국인의 유전적 변이형의 구조에 대한 기본 연구를 수행하여 질병 유전자 발굴을 촉진하고자 한다. 특히 인간 유전체형의 haplotype 연구는 한국인에게 빈발하는 당뇨, 천식, 골다공증과 같은 복합질병(complex diseases)의 원인 유전자 탐색에 유용한 지표로 사용될 것으로 기대된다. 방법 : 질병 원인 유전자 발굴을 촉진하기 위해서 질병 후보 유전자를 선정하여 많은 수의 새로운 SNP(single nucleotide polymorphism, 단일염기서열 다형성)를 발굴하고자 한다. SNP 발굴은 24명의 한국인 DNA 시료를 사용하여 direct sequencing 방법과 Polyphred software를 사용하여 이루어졌다. 또한 질병 후보 유전자에 존재하는 다수의 SNP를 선별하여 한국인에 존재하는 유전적 변이의 빈도를 조사하고 다른 인종간의 빈도를 비교해보았다. 결과 : 다수의 새로운 SNP가 질병 후보 유전자에서 sequencing방법으로 발굴되었다. SNP 유전형 분석에서는 한국인은 서양인과 아프리카인과는 아주 상이한 SNP 빈도의 분포를 보였으나 일본인과는 아주 유사한 빈도의 분포를 관측할 수 있었다. 한편, genome-wide scanning 연구 결과에서 얻어진 다양한 종류의 인간 복합질병 유전자 위치를 각 염색체 별로 중첩 시켰을 때 여러 곳의 중첩 된 염색체 위치(1q21, 2q33, 5q31-33, 6p21&11q13 등)가 발견되었다. 현재 본 연구 과제에서는 염색체 5q31-33와 22q13 지역에서 SNP 발굴과 LD block 구조에 대한 연구를 진행하고 있으며 5q31-33에 존재하는 29개 유전자를 우선적으로 선별하여 SNP를 발굴한 결과 총 292개의 SNP를 발굴하였다. 또한 uninformative한 SNP marker를 informative한 genetic marker로 사용하기 위해서 여러 SNP들을 조합하여 각 개체에 존재하는 haplotype을 찾아내는 hapolotype 구성 기술도 현재 구축한 상태이다. 결론 : 복합형질 질환의 원인 유전자 규명을 위한 한국인 haplotype 분석 연구는 생물학 및 의학 연구를 위한 기초 기반을 구축하고 소중한 기술적 자원을 제공할 것이다. 따라서 본 연구 과제는 한국인의 복합질병을 위한 질병의 예방, 진단 및 치료법 개발을 촉진할 것으로 기대된다.

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