한국인 Long Term Non Progressors로부터 분리된 HIV-1 env 및 nef 유전자와 이들의 면역 유전학적 특성 분석에 의한 질병진전 요인 규명

초록

목적 : 우리나라 HIV 감염자의 질병진전과 관련된 env 유전자의 변이를 분석하고 HLA 유전자와 연관성을 규명한다. 방법 : env 유전자의 염기서열 및 유연관계분석(phylogenetic analysis)은 env specific primer쌍(1st PCR: ED3/ED14; 2nd PCR: ED5/ED12)을 사용하여 gp120(V1-V5 region; 1.2kb)를 nested PCR, 클로닝, automatic DNA sequencing한 후 DNASTAR 프로그램을 이용하여 유연관계를 분석하였다. ARMS-PCR법을 이용하여 HLA class Ⅰ 유전자형, PCR-SSOP법을 이용하여 HLA class Ⅱ 유전자형을 분석하였다. 결과 : Long term non progressor(LTNP) 5명으로부터 수집된 이들의 평균 1년 간격의 serial sample로부터 증폭된 HIV-1 gp120 V1-V5 부위(1.2kb) 변이율을 분석한 결과 평균 2.38~6.45%(nucleotide level)을 보였다. V3 loop 35개 아미노산 중에서 11번 또는 25번에서 positive charged 아미노산인 arginine(R) 혹은 lysine(K)으로 바뀔 경우 모두 SI phenotype을 나타내었으며, 또한 11번 아미노산과 tetrameric motif 사이에 positive charge를 가진 아미노산이 삽입되었을 때 SI phenotype을 나타내었다. HLA class Ⅰ 대립유전자에서의 정상인과 HIV 감염자와의 연관성을 비교 분석한 결과 HLA-B*5401 대립유전자가 정상인에 비해 HIV 감염자에서 유의하게 증가하였다(정상인 5.3%, HTV 환자 20.0%, RR: 4.5; chi-square: 8.91). 결론 : HIV-1 증식 속도의 차이를 결정하는 것으로 추정되는 SI phenotype 연관 부위 즉, V3 loop 11번과 25번 아미노산/11번 아미노산과 tetramer motif 사이의 insertion 부위를 규명하였으며 HLA-B*5401이 HIV 질병 진전에 연관성이 있는 것으로 추정되었다.

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