KBN 인체자원 데이터 표준화 및 통합관리 체계 고도화

초록

ㅇ 본 사업은 KBN 질환자원 임상역학정보 표준화 확대 및 바이오 빅데이터 플랫폼 구축 사업을 목표로 KBN 임상역학정보 수집체계 표준화 및 고도화, 통합관리 시스템 고도화, 코호트 및 전처리 기능 고도화의 주요 3개 전략 수행하였음 ㅇ주요 3개 전략을 기반으로 고도화된 수집 및 품질관리 체계와 KBN 임상역학정보 빅데이터 공유·개방 활용 플랫폼을 구축 및 운영하였음 1) KBN 임상역학정보 수집체계 표준화 및 고도화 결과 - 기 구축된 KBN CDM 모델에 대해 기관들의 수요를 조사 및 적용하고, 수집 및 관리체계를 검토하고 KBN CDM의 국제표준 매핑사전을 검토 및 보완하여 개선된 KBN CDM의 활용을 제고시킴 - OMOP CDM과의 매핑정의서를 개발하고 해당 매핑정보 및 OMOP CDM 항목의 품질규칙을 개발하여 다기관 연구에 활용할 수 있는 기반을 확보 - 분석용 데이터를 위한 품질 규칙을 추가 생성하여 고도화된 품질체계 구축 - 효율적인 데이터 조회를 위해 질환별, 사업별 데이터 카탈로그를 개발 ※ 성과 : KBN CDM 정의서 V3.1 1건, KBN CDM 국제표준 매핑사전 1건, KBN CDM to OMOP CDM 정의서 2건, KBN OMOP CDM 품질정의서 1건 2) KBN 임상역학정보 통합관리 시스템 고도화 결과 - 시스템 운영 및 기능 고도화, 정보시스템 상호운용성 강화, 대용량 심층정보 활용 플랫폼 고도화를 통해 KBN 임상역학정보 통합관리 시스템을 고도화함 - 대용량 심층정보 활용 플랫폼에 대용량 TIFF 이미지의 자동압축기능을 추가하여 심층정보 이미지 로딩 시간을 단축함 - SSL VPN 사용자 관리를 통해 인증된 사용자만 대용량 바이오정보 활용 플랫폼에 접근할 수 있도록 하여 정보시스템의 상호운용성 및 보안을 강화함 ※ 성과 : KBN 빅데이터 플랫폼(KBN BRIDGE) 시스템 1건 3) KBN 임상역학정보 코호트 및 전처리 기능 고도화 - KBN Bridge에서 수집된 운영 데이터를 품질 검증을 통해 고품질의 데이터를 선별하고, 새로운 데이터베이스에 데이터를 연계하여 고도화된 데이터 분석을 수행하고자 함 - 고도화된 분석 기능은 기존 KBN 플랫폼을 통해 활용할 수 있도록 구성하여 신규 구성된 분석용 DB와 연동함으로써 코호트 및 전처리 기능을 제공함 - 위 임상역학정보 분석 고도화를 통해서 연구자는 고품질의 데이터를 쉽게 수집·활용이 가능하며 데이터 활용에 어려움을 겪는 연구자를 위해 기초 연구자료 정보 습득 및 통계화된 임상역학정보 데이터 활용이 가능함 ※ 성과 : KBN 분석 활용(KBN_ANALYSIS) 시스템 1건

ㅇ This project aimed to expand the standardization of clinical epidemiological information for KBN disease resources and establish a bio big data platform by pursuing three major strategies: standardization and enhancement of the KBN clinical epidemiological information collection system, advancement of the integrated management system, and improvement of cohort and preprocessing functions. ㅇ Based on these three key strategies, an advanced collection and quality management system and a platform for sharing and utilizing KBN clinical epidemiological big data were established and operated. 1) Results of the Standardization and Enhancement of the KBN Clinical Epidemiological Information Collection System - Conducted surveys on the needs of institutions for the existing KBN CDM model and applied the findings. Reviewed the collection and management system, and examined and refined the international standard mapping dictionary for KBN CDM, enhancing its usability. - Developed a mapping definition document for OMOP CDM, along with mapping information and quality rules for OMOP CDM items, creating a foundation for multi-institutional research. - Established an advanced quality management system by creating additional quality rules for analytical data. - Developed disease-specific and project-specific data catalogs for efficient data querying. ※ Outcome : KBN CDM Definition Document V3.1, KBN CDM International Standard Mapping Dictionary, KBN CDM to OMOP CDM Definition Documents, KBN OMOP CDM Quality Definition Document 2) Results of the Advancement of the KBN Clinical Epidemiological Information Integrated Management System - Enhanced the system through operational improvements, strengthening interoperability, and upgrading the large-scale deep information utilization platform. - Added an automatic compression function for large TIFF images to the platform, reducing loading time for deep information images. - Implemented SSL VPN user management, allowing only authenticated users to access the large-scale bioinformation utilization platform, thereby strengthening interoperability and security. ※ Outcome : KBN BRIDGE System 3) Results of the Enhancement of the KBN Clinical Epidemiological Information Cohort and Preprocessing Functions - Verified the quality of operational data collected through the KBN Bridge, selected high-quality data, and linked the data to a new database for advanced analysis. - Configured advanced analytical functions to be utilized through the existing KBN platform, and linked these functions to the newly created analytical database to provide cohort and preprocessing capabilities. ※ Outcome : KBN ANALYSIS System